一种具有安全保护装置的电动车供电系统及其控制方法，该系统包括动力电源及负载，以及安全保护装置，安全保护装置主要包括绝缘测试单元、预充电及负载测试单元、过流检测单元、负载电荷泄放单元、漏电检测单元、多功能检测板、多功能控制板、以及MCU；供电之前动力电源通过预充电回路对负载进行预充电，在检测负载两端电压为正常工作电压后，自动接通动力电源与负载之间的主电路，为负载供电。并在供电过程中实时监测主电路工作状态数据，当监测到过流、过压、漏电等故障数据时，切断动力电源与负载之间的主电路，并接通连接在负载上的电荷泄放电路，泄放负载电容上存储的电荷。达到保护动力电池组、重要负荷及车内电气设备安全之目的。