本发明公开了一种用于种植体系统的定位夹具，包括基座、多个夹持机构及定位机构；夹持机构包括两个夹持组件，夹持组件包括滑槽、滑块、连接杆及弹簧，滑块滑动设置在滑槽中，连接杆一端螺纹连接于滑块，弹簧套设在连接杆上，定位机构包括定位件及多个定位柱，定位柱设置有六棱柱。两个夹持组件的滑块靠近或远离移动可以将种植体体部夹持固定或松开；弹簧的弹力使滑块紧密抵靠于种植体体部，且避免刚性夹持对种植体体部造成破坏；定位机构的六棱柱可以将种植体体部进行定位，使得多个种植体体部上的内六角孔的保持同一方向的位置；整个定位夹具能够对种植体系统进行有效定位，以便准确测量六方尺寸，结构简单，便于批量测量。